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El Grupo de Salud Ambiental hace parte de la Subdirección Laboratorio Nacional de Referencia de la Dirección de Redes en Salud Pública. Como laboratorio Nacional de referencia aporta técnica y científicamente al desarrollo de la red nacional de laboratorios con la producción de bienes y prestación de servicios mediante programas de vigilancia por laboratorio de la calidad del agua para consumo humano, metales y no metales, vigilancia epidemiológica de plaguicidas y otras sustancias de interés en salud pública.
Desarrolla actividades de diagnóstico analítico en muestras de aguas y muestras biológicas, lidera la evaluación externa del desempeño (Programas PICCAP, PICC- VEO) y presta asistencia técnica a los laboratorios departamentales de salud pública.
Fortalece los laboratorios públicos y privados en diferentes niveles de complejidad en las áreas de aguas, sustancias químicas y ecotoxicidad y participa interinstitucionalmente a nivel nacional e internacional en el fortalecimiento de políticas de salud pública y ambiental, para el mejoramiento de la calidad de vida de la población Colombiana.